2016年のプロ野球ドラフト会議で横浜DeNAベイスターズ（DeNA）が指名した選手、全10名の一覧です。1位は濱口遥大（投手・神奈川大学）。
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1位 | 濱口遥大 | 投手 | 神奈川大学 | 入団 |
| 2位 | 水野滉也 | 投手 | 東海大学北海道キャンパス | 入団 |
| 3位 | 松尾大河 | 内野手 | 秀岳館高 | 入団 |
| 4位 | 京山将弥 | 投手 | 近江高 | 入団 |
| 5位 | 細川成也 | 外野手 | 明秀学園日立高 | 入団 |
| 6位 | 尾仲祐哉 | 投手 | 広島経済大学 | 入団 |
| 7位 | 狩野行寿 | 内野手 | 平成国際大学 | 入団 |
| 8位 | 進藤拓也 | 投手 | JR東日本 | 入団 |
| 9位 | 佐野恵太 | 外野手 | 明治大学 | 入団 |
◆ 育成ドラフト
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1位 | 笠井崇正 | 投手 | 信濃グランセローズ | 入団 |
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