2016年のプロ野球ドラフト会議で東京ヤクルトスワローズ（ヤクルト）が指名した選手、全7名の一覧です。1位は寺島成輝（投手・履正社高）。
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1位 | 寺島成輝 | 投手 | 履正社高 | 入団 |
| 2位 | 星知弥 | 投手 | 明治大学 | 入団 |
| 3位 | 梅野雄吾 | 投手 | 九州産業大学付属九州産業高 | 入団 |
| 4位 | 中尾輝 | 投手 | 名古屋経済大学 | 入団 |
| 5位 | 古賀優大 | 捕手 | 明徳義塾高 | 入団 |
| 6位 | 菊沢竜佑 | 投手 | 相双リテック | 入団 |
◆ 育成ドラフト
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1位 | 大村孟 | 捕手 | 石川ミリオンスターズ | 入団 |
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