2000年のプロ野球ドラフト会議でヤクルトスワローズ（ヤクルト）が指名した選手、全5名の一覧です。1位は平本学（投手・立命館大学）。
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1位 | 平本学 | 投手 | 立命館大学 | 入団 |
| 2位 | 鎌田祐哉 | 投手 | 早稲田大学 | 入団 |
| 3位 | 松谷秀幸 | 投手 | 興南高 | 入団 |
| 4位 | 坂元弥太郎 | 投手 | 浦和学院高 | 入団 |
| 5位 | 畠山和洋 | 内野手 | 専修大学北上高 | 入団 |
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