2003年のプロ野球ドラフト会議で日本ハムファイターズ（日本ハム）が指名した選手、全6名の一覧です。1位は糸井嘉男（投手・近畿大学）。
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 自由獲得枠 | 糸井嘉男 | 投手 | 近畿大学 | 入団 |
| 2巡目 | 須永英輝 | 投手 | 浦和学院高 | 入団 |
| 4巡目 | 押本健彦 | 投手 | 日産自動車 | 入団 |
| 5巡目 | 稲田直人 | 内野手 | JFE西日本 | 入団 |
| 6巡目 | 金森敬之 | 投手 | 東海大学菅生高 | 入団 |
| 7巡目 | 渡部龍一 | 捕手 | 札幌第一高 | 入団 |
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