1999年のプロ野球ドラフト会議で日本ハムファイターズ（日本ハム）が指名した選手、全7名の一覧です。1位は正田樹（投手・桐生第一高）。
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1位 | 正田樹 | 投手 | 桐生第一高 | 入団 |
| 2位 | 田中賢介 | 内野手 | 東福岡高 | 入団 |
| 3位 | 吉崎勝 | 投手 | ミキハウス | 入団 |
| 4位 | 佐々木貴賀 | 投手 | 高松西高 | 入団 |
| 5位 | 藤崎大輔 | 捕手 | 中央学院高 | 入団 |
| 6位 | 神島崇 | 投手 | インディアンヒルズ短期大学卒 | 入団 |
| 7位 | 遠藤良平 | 投手 | 東京大学 | 入団 |
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