2001年のプロ野球ドラフト会議で横浜ベイスターズ（DeNA）が指名した選手、全5名の一覧です。1位は秦裕二（投手・智辯学園高）。
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1巡目 | 秦裕二 | 投手 | 智辯学園高 | 入団 |
| 3巡目 | 小田嶋正邦 | 捕手 | 東海大学 | 入団 |
| 4巡目 | 岡本直也 | 投手 | 岡山理科大学附属高 | 入団 |
| 5巡目 | 田崎昌弘 | 投手 | JR九州 | 入団 |
| 6巡目 | 千葉英貴 | 投手 | 日本大学第三高 | 入団 |
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