1988年のプロ野球ドラフト会議でヤクルトアトムズ（ヤクルト）が指名した選手、全6名の一覧です。1位は川崎憲次郎（投手・津久見高）。
| 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 | 狀況 |
|---|---|---|---|---|
| 1位 | 川崎憲次郎 | 投手 | 津久見高 | 入団 |
| 2位 | 岡幸俊 | 投手 | 高知商業高 | 入団 |
| 3位 | 笘篠賢治 | 外野手 | 中央大学 | 入団 |
| 4位 | 幸田正広 | 内野手 | 安田学園高 | 入団 |
| 5位 | 関根毅 | 外野手 | 東海大学 | 入団 |
| 6位 | 天野武文 | 捕手 | 瀬戸内高 | 入団 |
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